Salvo algunas incursiones de las Fuerzas Armadas Revolucionarias de Colombia (FARC) en el sur del país, la jornada electoral transcurrió normalmente. Al cierre de esta edición ninguno de los candidatos había denunciado irregularidades, aunque el viernes pidieron que se investigara una controversial reunión de Santos con el jefe del sindicato de la Registraduría Nacional del Estado Civil, institución encargada del conteo de votos.

Santos explicó a El Nuevo Herald que dicha reunión fue solicitada por el líder sindical para comunicarle personalmente que los escrutinios no serían improvisados como los congresionales de marzo, pero Vargas Lleras y Petro, señalaron que si ese era el motivo de la reunión, Santos debía haberse entrevistado con el director de la Registraduría y no con un dirigente sindical.

Algunos medios de comunicación denunciaron que la campaña de Santos había utilizado afiliados a programas oficiales tales como Familias en Acción y el Instituto Colombiano de Bienestar Familiar, para engrosar sus manifestaciones políticas y forzarlos a votar por él.

Santos, un aliado del gobierno de Estados Unidos en la lucha contra la guerrilla y el narcotráfico, consolidó su estrategia electoral invocando los éxitos de la seguridad democrática del presidente Uribe, en cuya administración se desempeño como ministro de Defensa.

En sus discursos señaló que él encarna la misión de llevar el legado de Uribe a una nueva meta: la prosperidad democrática, una plataforma electoral que promete mayores empleos, más dinero en la inversión social y en obras de infraestructura.

Como ministro y candidato ha sido fuerte en sus pronunciamientos contra los presidentes de los vecinos Ecuador y Venezuela.

Santos dedicó su triunfo a su padre y a su abuelo, ambos periodistas y copropietarios del tradicional diario liberal El Tiempo de Bogotá, y agradeció a Uribe, al que calificó como "el mejor presidente que ha tenido Colombia’’

"Gracias a usted, presidente, estas elecciones no giraron en torno a las FARC sino a la educación y la prosperidad’’, agregó Santos.